OpenFISH是一种开源、具成本效益且具备单细胞分辨率的空间转录组学平台，它成功实现了与 MALDI-MSI（基质辅助激光解吸/电离质谱成像）在同一组织切片上的无缝集成。通过使用聚-L-赖氨酸（PLL）涂层的铟锡氧化物（ITO）载玻片和优化的组织处理流程，该方法解决了硬件与化学不兼容的难题，消除了质谱成像引起的背景干扰并保留了 RNA 信息。该平台能够绘制神经系统中的细胞类型特异性代谢模式，并在 5xFAD 阿尔茨海默病模型中识别出小胶质细胞、兴奋性神经元和少突神经元的代谢变化。此外，OpenFISH 还能单独量化免疫刺激后的转座子激活，并在雷勒（Reeler）突变小鼠中发现纹状体 D1 神经元的模式变化。与商业平台相比，这种多模态工作流程为探索基因表达与代谢之间的相互作用提供了一个灵活且定制化的框架。 References: Li X, Huang Y, Wang S, et al. OpenFISH enables same-section spatial transcriptomics and MALDI-MSI integration[J]. Neuron, 2026. 前往小宇宙评论区与主播互动 Rss Apple Podcaster →
